제주에 국립종자원이 설치되면 제주에서 재배하는 열대, 아열대 작물의 품종보호 출원을 위해 국립종자원이 있는 다른 지역까지 가야 하는 불편을 덜게 된다. 감귤, 채소, 화훼류 등 농작물의 종자 유통질서 확립과 자유무역협정(FTA), 국제식물 신품종보호동맹(UPOV)의 품종보호 등에도 능동적으로 대처할 수 있을 것으로 제주도는 기대했다.
제주도는 4월 종자산업과 지역농업 발전, 품종 육성 권리 보호 등을 위해 국립종자원 제주지원을 설치해 줄 것을 농림수산식품부와 국립종자원에 건의했다.
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